深圳不少小学的小升初喜报中，往往会将学生升入深圳中学初中部3+2、3+3班的数据单独列出，足见其初中部的实力。
深圳中学初中部原名为洪湖中学，建于1985年7月，是罗湖区一所普通完全中学，1996年通过了市教育督导室市一级学校评估。1998年7月，洪湖中学与深圳中学合并，改名为深圳中学初中部（以下简称“深中”）。另外，由于学校的校树及校歌为“凤凰木”，坊间也多以“凤凰木”来指代深中。
深中的中考成绩向来不错，2012年至2016年四大录取人数在150~210人之间，四大率维持在23%~36%的水平。据主流民办教育机构的数据，深中2017年中招录取人数为448人，四大录取134人，四大率29.91%；八大录取177人，八大率39.51%，排名全市第四；十大录取185人，十大率41.29%，排名全市第六；公办录取人数是347人，公办普高率77.46%。
学校位于罗湖区贝丽南路，占地面积26602平方米，校园内除教学楼、办公楼、实验楼，还设有一个小花园，环境优美。学校的运动场所包括300米跑道、篮球场、羽毛球场、排球场及乒乓球场等，另有食堂、书屋和便利店。校园外的医院、超市、银行、饮食店等也十分齐全。不过由于深中初中部建校时间较长，其楼房显得比较老旧。
2017年，深中招收地段生班6个，特长生班2个，3+2班和3+3班各4个，其中新增一个“博雅班”，与特长生及地段生编入一个特长生班。“博雅班”录取标准为学校组织的小升初选拔考试中语文满分，该班的培养注重文科，但2018年是否继续开设还没有准确答案。
深中的3+2班和3+3班常被人拿来对比。3+2班在高中部上课，注重竞赛，数学采用学校自编教材，难度大，整体课程进度最快，学生在高二时就能参加高考。3+2班的课程也稍多，除了数学注重竞赛，语文注重阅读和写作，英语还拓展口语，聘请外籍教师任课。同时该班的作业量大，学习压力不小，班里女生人数极少。不过3+2班的班级管理相对宽松，意在培养学生的自觉性。3+2班的学生同样需要参加中考，如果成绩不理想，高中时可以留在深中但要转到其它班级。有意进入3+2班的学生可在学校官网投递简历，另外，获得华附录取资格的学生也有机会被3+2点招录取。
3+3班可视作初中部的超常班，在初中部上课，数学课与3+2班采用同样的学校自编教材，整体课程进度比3+2慢但比普通班快。课程设置上，3+3的拓展不如3+2多，不过语文和英语仍补充了其它教材，如语文的演讲及英语的口语等。3+3的作业量同样很多，学生时常到晚上12点才能完成。并且该班以中考为目标，在管理上相对严格。3+3班的学生如果成绩突出，可通过考试进入3+2班。
除了以上两个班级，深中的其他班学习压力同样不小，平时的作业至少需要两小时完成，并且学生在校外报名各类辅导班成风。2016年及以前，学校在初一时就开设物理课，2017年初一的物理课则为选修，但由于报名学生众多，需要参加考试后方可参加。学校每天下午4:40放学，放学后学生必须在操场跑步后才能回家。
虽然学习压力大，但深中也有丰富多样的社团，包括动漫社、篮球社、电影社等，学生还可以向相关老师申请创办社团。同时学校也有在高中部举办的田径运动会、十大歌手比赛、班级表演等活动，不过可惜的是某些活动初三学生不能参加。
位于初中部的3+3班和普通班采取走读制，不安排住宿，中午可以回家也可以在学校用餐；位于高中部的3+2班则可以安排住宿，宿舍为8人间。两校区的食堂均提供丰富的菜品，但味道方面学生表示“不咋地”。
